В Филиале функционируют два факультета:
В учебном процессе факультетов реализуются учебные планы, подготовленные в соответствии с Федеральными государствен¬ными образовательными стандартами третьего поколения и утвержденные ректором Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова, академиком В.А. Садовничим. На факультетах предусмотрена только очная (дневная) форма обучения. Подготовкой высококвалифицированных кадров на факультетах занимается командированный профессорско-преподавательский состав Московского государственного университета имени М.В.Ломоносова и опытнейшие преподаватели Таджикистана.