Директорат - это коллегиальный орган управления, созданный для координации усилий руководства по управлению, для предварительного рассмотрения приоритетных вопросов, подготовки и проведения значимых мероприятий, а также решения текущих вопросов. В своей деятельности Директорат руководствуется Конституцией Республики Таджикистан и Российской Федерации, действующим законодательством Республики Таджикистан и Российской Федерации, Уставом Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова, Положением о филиале Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова в городе Душанбе, а также локальными нормативными актами.
В состав Директората входят директор, исполнительный директор, заместители исполнительного директора, руководители структурных подразделений и секретарь. Заседания Директората проводит директор, а в его отсутствие исполнительный директор не реже одного раза в два месяца. Оно считается правомочным, если на нем присутствует более половины членов Директората. Исполнения решений Директората обязательны для профессорско-преподавательского состава, сотрудников и студентов.