В учебном процессе Филиала используются все существующие виды обучения – лекционные занятия, практические, лабораторные. Наличие современного лабораторного практикума позволяет глубже освоить теоретический материал, приобрести практические навыки работы с использованием лабораторного оборудования. Лабораторный практикум - существенный элемент учебного процесса, в ходе которого студенты фактически впервые сталкиваются с самостоятельной практической деятельностью в конкретной области. Занятия в лабораториях являются связующим звеном между углубленной теоретической работой обучающихся на лекциях, семинарах и применением знаний на практике.
Лаборатория химии в структуре Филиала МГУ имени М.В.Ломоносова в городе Душанбе была создана в 2010 году, после образования самого Филиала. Первоначально химическое оборудование и реактивы были приобретены по инициативе доктора технических наук Умаровой Татьяной Мухсиновной. С января 2011 заведующим лабораторией химии был избран кандидат хи-мических наук Мирзоев Баходур. Благодаря приложенным усилиям Мирзоева Баходура были решены вопросы установки оборудования и были заключены договора с фирмами для приобретения реактивов и кислот. Абдурахимова М.К. выполняла обязанности лаборанта лаборатории химии с февраля 2011 года. В начале её работы лаборатория приобрела стандартный вид. Её активная и творческая работа вносила неоценимый вклад в профессиональную подготовку студентов и создавала комфортные условия для работы преподавателей. Она занималась обустройством и оформлением лаборатории и препараторской. Она подготавливала материалы - растворы и оборудование для каждого курса отдельно. В конце 2011 года она получила благодарственное письмо за помощь и организацию лабораторного практикума по химии от декана химического факультета Московского Государственного Университета Академика РАН, профессора В.В.Лунина. За активную работу в 2014 году её перевели на должность заведующей лабораторией химии. В 2012 году, благодаря усилиям директора Филиала, были приобретены: ИК-спектрофотометр Фурье Spectrum TWO и сканирующий двухлучевой УФ-спектрофотометр Lamda-35 производства Perkin Elmer. Представитель этой фирмы приехал, установил и обучил работников лаборатории. Оборудованием пользуются студенты, которые занимаются НИР, аспиранты, докторанты. На основании приобретенных приборов в 2012 году была открыта лаборатория «Физико-химические методы анализа».
В лаборатории пользуются бинокулярным микроскопом марки «Motic». Лаборатория химии оснащена достаточным количеством демонстрационных приборов для проведения занятий по общему курсу химии со студентами Филиала. В 2014 году при помощи доцента кафедры Физической химии химического факультета МГУ имени Ломоносова, кандидата химических наук Воронцова Александра Вячеславовича была организована лаборатория Физической химии. Все приборы и установки были произведены и закуплены в России. Установкой занимался сам Воронцов А.В. В комплект лабораторных работ входит: кинетика-1, кинетика-2, электрохимия, тепловые эффекты, кондуктометрия, ионометрия, спектрофотометр «Юнико» КФК-3КМ. Все приборы были соединены ноутбуками и были запрограммированы. Студентам работать с ними комфортно и крайне эффективно, после проведения работ, исходя из расчетов, они быстро и четко обрабатывают полученные результаты. По предложению исполнительного директора Филиала Мирзоева Сайъло Хабибулоевича и московского преподавателя Харлова Александра Евгеньевича в 2016 году была организована лаборатория Коллоидной химии. Установки и оборудование тоже были привезены из России. Было приобретено следующее оборудование: тензиометр, термостат LOIP LT, перемешивающие устройства, гониометр, турбидиметр, прибор Рабиновича-Фодимана. Все приборы были установлены и протестированы самим Харловым А.Е. На фоне приобретенных приборов у студентов появилась возможность заниматься научной работой.
В лаборатории химии студенты занимаются НИР под руководством Умаровой Татьяны Мухсиновны и Мирзоева Баходура. На основе проведённых исследований они должны будут выступать на конференциях и публиковать статьи в разных внутренних и зарубежных журналах.
В качестве лаборанта в лаборатории химии работает выпускница Филиала Хасанова Камилла Тимуровна.